Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC25A52Q3SY17 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC25A52Q3SY17 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms