Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PPP1R3AQ16821 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPP1R3AQ16821 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms