Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK4Q16099 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK4Q16099 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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