Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP3Q15836 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP3Q15836 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP3Q15836 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP3Q15836 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP3Q15836 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP3Q15836 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAMP3Q15836 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP3Q15836 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP3Q15836 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP3Q15836 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP3Q15836 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP3Q15836 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP3Q15836 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP3Q15836 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VAMP3Q15836 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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VAMP3Q15836 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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VAMP3Q15836 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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VAMP3Q15836 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VAMP3Q15836 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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