Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABEP1Q15276 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
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