Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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