Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEDD9Q14511 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD9Q14511 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
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