Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RBM39Q14498 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms