Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP1A4Q13733 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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