Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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TRAF3Q13114 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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TRAF3Q13114 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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TRAF3Q13114 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAF3Q13114 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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