Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PRDM2Q13029 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRDM2Q13029 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRDM2Q13029 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
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