Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL6Q02878 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms