Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF8Q02556 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF8Q02556 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms