Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP2P81877 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP2P81877 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms