Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms