Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM4P67936 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM4P67936 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM4P67936 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM4P67936 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM4P67936 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM4P67936 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPM4P67936 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM4P67936 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM4P67936 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM4P67936 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM4P67936 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM4P67936 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM4P67936 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM4P67936 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM4P67936 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM4P67936 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM4P67936 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM4P67936 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM4P67936 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM4P67936 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM4P67936 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM4P67936 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM4P67936 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM4P67936 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM4P67936 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM4P67936 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM4P67936 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM4P67936 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPM4P67936 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM4P67936 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM4P67936 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM4P67936 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM4P67936 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM4P67936 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM4P67936 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM4P67936 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM4P67936 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM4P67936 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM4P67936 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPM4P67936 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TPM4P67936 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TPM4P67936 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TPM4P67936 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TPM4P67936 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM4P67936 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM4P67936 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM4P67936 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM4P67936 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM4P67936 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM4P67936 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM4P67936 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM4P67936 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM4P67936 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPM4P67936 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM4P67936 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM4P67936 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM4P67936 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM4P67936 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM4P67936 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM4P67936 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM4P67936 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM4P67936 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM4P67936 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM4P67936 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM4P67936 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM4P67936 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPM4P67936 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM4P67936 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM4P67936 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM4P67936 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM4P67936 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM4P67936 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM4P67936 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM4P67936 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM4P67936 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM4P67936 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM4P67936 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM4P67936 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM4P67936 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM4P67936 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM4P67936 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM4P67936 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM4P67936 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPM4P67936 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM4P67936 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM4P67936 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM4P67936 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM4P67936 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM4P67936 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM4P67936 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM4P67936 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM4P67936 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM4P67936 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM4P67936 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM4P67936 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPM4P67936 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM4P67936 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM4P67936 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPM4P67936 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms