Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCS1P62166 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCS1P62166 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCS1P62166 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCS1P62166 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCS1P62166 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCS1P62166 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NCS1P62166 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCS1P62166 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NCS1P62166 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCS1P62166 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCS1P62166 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCS1P62166 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCS1P62166 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCS1P62166 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCS1P62166 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCS1P62166 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCS1P62166 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCS1P62166 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCS1P62166 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NCS1P62166 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCS1P62166 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCS1P62166 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCS1P62166 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCS1P62166 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCS1P62166 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCS1P62166 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCS1P62166 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCS1P62166 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCS1P62166 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCS1P62166 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCS1P62166 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCS1P62166 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCS1P62166 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCS1P62166 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCS1P62166 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCS1P62166 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCS1P62166 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NCS1P62166 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NCS1P62166 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCS1P62166 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCS1P62166 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCS1P62166 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCS1P62166 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCS1P62166 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCS1P62166 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCS1P62166 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCS1P62166 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCS1P62166 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCS1P62166 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCS1P62166 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCS1P62166 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCS1P62166 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCS1P62166 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NCS1P62166 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCS1P62166 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCS1P62166 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NCS1P62166 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCS1P62166 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCS1P62166 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCS1P62166 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCS1P62166 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCS1P62166 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCS1P62166 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCS1P62166 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCS1P62166 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCS1P62166 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NCS1P62166 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCS1P62166 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NCS1P62166 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCS1P62166 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCS1P62166 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCS1P62166 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCS1P62166 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCS1P62166 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCS1P62166 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCS1P62166 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCS1P62166 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCS1P62166 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCS1P62166 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCS1P62166 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCS1P62166 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCS1P62166 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCS1P62166 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCS1P62166 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCS1P62166 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCS1P62166 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCS1P62166 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCS1P62166 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCS1P62166 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCS1P62166 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCS1P62166 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCS1P62166 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCS1P62166 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCS1P62166 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NCS1P62166 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCS1P62166 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCS1P62166 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCS1P62166 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NCS1P62166 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms