Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTXN1P60606 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms