Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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PGGT1BP53609 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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PGGT1BP53609 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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PGGT1BP53609 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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PGGT1BP53609 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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PGGT1BP53609 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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PGGT1BP53609 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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PGGT1BP53609 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PGGT1BP53609 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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