Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOSBP53539 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOSBP53539 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOSBP53539 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOSBP53539 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOSBP53539 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOSBP53539 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOSBP53539 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOSBP53539 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOSBP53539 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOSBP53539 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOSBP53539 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOSBP53539 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOSBP53539 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOSBP53539 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOSBP53539 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOSBP53539 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOSBP53539 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOSBP53539 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOSBP53539 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOSBP53539 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOSBP53539 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOSBP53539 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOSBP53539 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOSBP53539 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOSBP53539 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOSBP53539 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOSBP53539 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOSBP53539 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOSBP53539 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOSBP53539 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOSBP53539 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOSBP53539 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOSBP53539 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOSBP53539 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOSBP53539 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOSBP53539 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOSBP53539 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOSBP53539 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOSBP53539 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOSBP53539 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOSBP53539 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOSBP53539 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOSBP53539 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOSBP53539 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOSBP53539 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOSBP53539 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOSBP53539 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOSBP53539 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOSBP53539 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOSBP53539 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOSBP53539 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOSBP53539 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOSBP53539 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOSBP53539 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOSBP53539 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOSBP53539 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOSBP53539 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOSBP53539 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOSBP53539 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOSBP53539 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOSBP53539 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOSBP53539 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOSBP53539 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOSBP53539 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOSBP53539 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOSBP53539 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOSBP53539 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOSBP53539 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOSBP53539 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOSBP53539 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOSBP53539 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOSBP53539 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOSBP53539 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOSBP53539 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOSBP53539 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOSBP53539 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOSBP53539 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOSBP53539 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FOSBP53539 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOSBP53539 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOSBP53539 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOSBP53539 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOSBP53539 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOSBP53539 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOSBP53539 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOSBP53539 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOSBP53539 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOSBP53539 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOSBP53539 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOSBP53539 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOSBP53539 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOSBP53539 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOSBP53539 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOSBP53539 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOSBP53539 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOSBP53539 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOSBP53539 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FOSBP53539 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOSBP53539 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms