Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB27AP51159 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms