Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTRLP40313 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTRLP40313 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTRLP40313 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CTRLP40313 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTRLP40313 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTRLP40313 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTRLP40313 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTRLP40313 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTRLP40313 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTRLP40313 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTRLP40313 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTRLP40313 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTRLP40313 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTRLP40313 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTRLP40313 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTRLP40313 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTRLP40313 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTRLP40313 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CTRLP40313 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTRLP40313 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTRLP40313 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTRLP40313 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTRLP40313 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTRLP40313 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRLP40313 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRLP40313 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRLP40313 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRLP40313 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRLP40313 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRLP40313 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRLP40313 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRLP40313 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRLP40313 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRLP40313 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRLP40313 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRLP40313 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRLP40313 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRLP40313 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRLP40313 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRLP40313 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRLP40313 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRLP40313 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRLP40313 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRLP40313 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRLP40313 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRLP40313 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRLP40313 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRLP40313 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRLP40313 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRLP40313 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRLP40313 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRLP40313 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRLP40313 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRLP40313 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRLP40313 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRLP40313 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRLP40313 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRLP40313 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRLP40313 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRLP40313 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRLP40313 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRLP40313 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRLP40313 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRLP40313 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRLP40313 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRLP40313 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRLP40313 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRLP40313 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRLP40313 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRLP40313 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRLP40313 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRLP40313 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRLP40313 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRLP40313 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRLP40313 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRLP40313 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRLP40313 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRLP40313 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRLP40313 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRLP40313 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRLP40313 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRLP40313 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRLP40313 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRLP40313 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRLP40313 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRLP40313 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRLP40313 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRLP40313 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRLP40313 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRLP40313 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRLP40313 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRLP40313 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRLP40313 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRLP40313 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRLP40313 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRLP40313 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRLP40313 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRLP40313 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTRLP40313 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms