Protein–RNA interactions for Protein: P30203

CD6, T-cell differentiation antigen CD6, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD6P30203 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD6P30203 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD6P30203 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD6P30203 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD6P30203 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD6P30203 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD6P30203 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD6P30203 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD6P30203 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD6P30203 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD6P30203 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD6P30203 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD6P30203 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD6P30203 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD6P30203 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD6P30203 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD6P30203 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD6P30203 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD6P30203 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD6P30203 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD6P30203 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD6P30203 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD6P30203 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD6P30203 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CD6P30203 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD6P30203 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD6P30203 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CD6P30203 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD6P30203 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD6P30203 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD6P30203 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD6P30203 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD6P30203 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD6P30203 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CD6P30203 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD6P30203 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD6P30203 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD6P30203 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD6P30203 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD6P30203 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD6P30203 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD6P30203 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD6P30203 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CD6P30203 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD6P30203 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD6P30203 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD6P30203 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD6P30203 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD6P30203 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD6P30203 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CD6P30203 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD6P30203 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD6P30203 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD6P30203 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD6P30203 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD6P30203 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD6P30203 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD6P30203 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD6P30203 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD6P30203 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD6P30203 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD6P30203 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD6P30203 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CD6P30203 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD6P30203 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD6P30203 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD6P30203 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD6P30203 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD6P30203 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD6P30203 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD6P30203 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD6P30203 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD6P30203 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD6P30203 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD6P30203 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CD6P30203 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD6P30203 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CD6P30203 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD6P30203 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD6P30203 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD6P30203 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD6P30203 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD6P30203 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD6P30203 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD6P30203 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD6P30203 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD6P30203 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD6P30203 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD6P30203 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD6P30203 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CD6P30203 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD6P30203 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD6P30203 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD6P30203 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD6P30203 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD6P30203 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD6P30203 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD6P30203 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD6P30203 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD6P30203 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms