Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMOD1P29536 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMOD1P29536 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMOD1P29536 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms