Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHATP28329 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHATP28329 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHATP28329 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHATP28329 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHATP28329 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHATP28329 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHATP28329 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHATP28329 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHATP28329 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHATP28329 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHATP28329 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHATP28329 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHATP28329 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHATP28329 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHATP28329 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHATP28329 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHATP28329 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHATP28329 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHATP28329 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHATP28329 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHATP28329 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHATP28329 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHATP28329 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CHATP28329 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHATP28329 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHATP28329 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHATP28329 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHATP28329 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHATP28329 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHATP28329 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHATP28329 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHATP28329 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHATP28329 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHATP28329 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHATP28329 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHATP28329 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHATP28329 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHATP28329 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHATP28329 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHATP28329 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHATP28329 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHATP28329 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHATP28329 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHATP28329 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHATP28329 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHATP28329 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHATP28329 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHATP28329 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHATP28329 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHATP28329 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHATP28329 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHATP28329 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHATP28329 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHATP28329 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHATP28329 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CHATP28329 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHATP28329 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHATP28329 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHATP28329 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHATP28329 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHATP28329 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHATP28329 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHATP28329 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHATP28329 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHATP28329 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHATP28329 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHATP28329 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHATP28329 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHATP28329 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHATP28329 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHATP28329 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHATP28329 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHATP28329 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHATP28329 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHATP28329 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHATP28329 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHATP28329 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHATP28329 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHATP28329 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHATP28329 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHATP28329 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHATP28329 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHATP28329 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHATP28329 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHATP28329 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHATP28329 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHATP28329 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHATP28329 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHATP28329 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHATP28329 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHATP28329 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHATP28329 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHATP28329 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHATP28329 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHATP28329 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHATP28329 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHATP28329 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHATP28329 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHATP28329 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms