Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HTR2AP28223 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms