Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IL3RAP26951 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IL3RAP26951 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms