Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCL3P20749 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCL3P20749 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCL3P20749 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCL3P20749 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCL3P20749 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCL3P20749 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCL3P20749 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCL3P20749 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCL3P20749 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCL3P20749 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCL3P20749 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCL3P20749 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCL3P20749 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCL3P20749 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCL3P20749 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BCL3P20749 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCL3P20749 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCL3P20749 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCL3P20749 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCL3P20749 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCL3P20749 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCL3P20749 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCL3P20749 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCL3P20749 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCL3P20749 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCL3P20749 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCL3P20749 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCL3P20749 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCL3P20749 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BCL3P20749 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BCL3P20749 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BCL3P20749 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BCL3P20749 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BCL3P20749 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BCL3P20749 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BCL3P20749 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BCL3P20749 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BCL3P20749 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BCL3P20749 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BCL3P20749 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BCL3P20749 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BCL3P20749 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BCL3P20749 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BCL3P20749 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BCL3P20749 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BCL3P20749 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BCL3P20749 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BCL3P20749 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BCL3P20749 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BCL3P20749 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BCL3P20749 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BCL3P20749 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BCL3P20749 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BCL3P20749 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BCL3P20749 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BCL3P20749 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BCL3P20749 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BCL3P20749 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BCL3P20749 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BCL3P20749 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BCL3P20749 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BCL3P20749 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BCL3P20749 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BCL3P20749 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCL3P20749 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCL3P20749 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCL3P20749 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCL3P20749 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCL3P20749 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCL3P20749 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BCL3P20749 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCL3P20749 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCL3P20749 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCL3P20749 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCL3P20749 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCL3P20749 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCL3P20749 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCL3P20749 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCL3P20749 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCL3P20749 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCL3P20749 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCL3P20749 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCL3P20749 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCL3P20749 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCL3P20749 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCL3P20749 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCL3P20749 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCL3P20749 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCL3P20749 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCL3P20749 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BCL3P20749 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCL3P20749 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCL3P20749 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCL3P20749 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCL3P20749 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCL3P20749 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCL3P20749 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCL3P20749 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCL3P20749 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms