Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP2B1P20020 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B1P20020 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms