Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSP16219 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSP16219 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSP16219 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSP16219 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSP16219 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSP16219 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSP16219 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACADSP16219 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSP16219 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSP16219 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSP16219 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSP16219 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSP16219 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSP16219 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSP16219 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSP16219 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSP16219 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSP16219 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSP16219 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACADSP16219 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACADSP16219 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACADSP16219 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACADSP16219 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACADSP16219 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSP16219 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSP16219 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSP16219 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSP16219 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSP16219 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSP16219 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSP16219 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSP16219 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSP16219 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSP16219 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSP16219 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSP16219 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSP16219 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSP16219 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSP16219 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSP16219 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSP16219 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSP16219 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSP16219 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACADSP16219 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSP16219 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSP16219 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSP16219 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSP16219 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSP16219 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSP16219 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSP16219 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSP16219 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSP16219 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSP16219 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSP16219 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSP16219 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSP16219 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSP16219 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSP16219 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSP16219 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSP16219 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSP16219 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSP16219 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSP16219 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSP16219 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACADSP16219 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSP16219 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSP16219 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSP16219 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSP16219 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSP16219 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSP16219 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACADSP16219 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms