Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM228BP0C875 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM228BP0C875 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms