Protein–RNA interactions for Protein: O95954

FTCD, Formimidoyltransferase-cyclodeaminase, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTCDO95954 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FTCDO95954 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FTCDO95954 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FTCDO95954 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FTCDO95954 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FTCDO95954 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FTCDO95954 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FTCDO95954 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FTCDO95954 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FTCDO95954 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FTCDO95954 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FTCDO95954 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FTCDO95954 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FTCDO95954 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FTCDO95954 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FTCDO95954 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FTCDO95954 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FTCDO95954 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FTCDO95954 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FTCDO95954 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FTCDO95954 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FTCDO95954 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FTCDO95954 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FTCDO95954 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FTCDO95954 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FTCDO95954 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FTCDO95954 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FTCDO95954 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FTCDO95954 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
FTCDO95954 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FTCDO95954 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FTCDO95954 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FTCDO95954 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FTCDO95954 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FTCDO95954 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FTCDO95954 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FTCDO95954 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FTCDO95954 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FTCDO95954 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FTCDO95954 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FTCDO95954 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FTCDO95954 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FTCDO95954 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FTCDO95954 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FTCDO95954 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FTCDO95954 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FTCDO95954 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FTCDO95954 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FTCDO95954 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FTCDO95954 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FTCDO95954 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FTCDO95954 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FTCDO95954 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FTCDO95954 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FTCDO95954 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FTCDO95954 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FTCDO95954 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FTCDO95954 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FTCDO95954 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FTCDO95954 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FTCDO95954 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FTCDO95954 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FTCDO95954 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FTCDO95954 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FTCDO95954 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FTCDO95954 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FTCDO95954 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FTCDO95954 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FTCDO95954 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FTCDO95954 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FTCDO95954 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FTCDO95954 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FTCDO95954 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FTCDO95954 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FTCDO95954 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FTCDO95954 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FTCDO95954 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FTCDO95954 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FTCDO95954 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FTCDO95954 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FTCDO95954 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FTCDO95954 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FTCDO95954 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FTCDO95954 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FTCDO95954 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FTCDO95954 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FTCDO95954 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FTCDO95954 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FTCDO95954 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FTCDO95954 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FTCDO95954 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FTCDO95954 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FTCDO95954 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FTCDO95954 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FTCDO95954 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FTCDO95954 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FTCDO95954 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FTCDO95954 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FTCDO95954 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FTCDO95954 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms