Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MSCO60682 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MSCO60682 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MSCO60682 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MSCO60682 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MSCO60682 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MSCO60682 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MSCO60682 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MSCO60682 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MSCO60682 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MSCO60682 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MSCO60682 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MSCO60682 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MSCO60682 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MSCO60682 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MSCO60682 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MSCO60682 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MSCO60682 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MSCO60682 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MSCO60682 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MSCO60682 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MSCO60682 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MSCO60682 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MSCO60682 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSCO60682 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSCO60682 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSCO60682 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSCO60682 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSCO60682 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSCO60682 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSCO60682 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MSCO60682 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSCO60682 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSCO60682 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSCO60682 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSCO60682 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSCO60682 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSCO60682 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSCO60682 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSCO60682 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSCO60682 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSCO60682 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSCO60682 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSCO60682 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSCO60682 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSCO60682 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSCO60682 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSCO60682 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSCO60682 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSCO60682 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSCO60682 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSCO60682 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSCO60682 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSCO60682 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSCO60682 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSCO60682 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSCO60682 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSCO60682 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSCO60682 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSCO60682 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSCO60682 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSCO60682 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSCO60682 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSCO60682 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSCO60682 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSCO60682 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSCO60682 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSCO60682 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSCO60682 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSCO60682 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSCO60682 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSCO60682 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSCO60682 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSCO60682 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSCO60682 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSCO60682 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSCO60682 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSCO60682 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSCO60682 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSCO60682 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSCO60682 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSCO60682 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSCO60682 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSCO60682 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSCO60682 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSCO60682 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSCO60682 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSCO60682 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MSCO60682 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSCO60682 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSCO60682 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSCO60682 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSCO60682 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSCO60682 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSCO60682 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSCO60682 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSCO60682 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSCO60682 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSCO60682 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSCO60682 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms