Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF3O43395 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF3O43395 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms