Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 DCAF11-226ENST00000559796 476 ntTSL 415.66■□□□□ 0.11e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 CCND1-205ENST00000542367 476 ntTSL 1 (best)15.6■□□□□ 0.091e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.091e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 DCAF11-235ENST00000561016 522 ntTSL 415.58■□□□□ 0.081e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 AGTRAP-210ENST00000491346 1116 ntTSL 515.33■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 SUPT5H-208ENST00000595368 659 ntTSL 215.27■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 DCAF11-232ENST00000560713 543 ntTSL 415.05■□□□□ -01e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 DCAF11-221ENST00000559382 549 ntTSL 515.05■□□□□ -01e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 ARAP1-218ENST00000543868 507 ntTSL 214.98□□□□□ -0.011e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.021e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 RPGR-206ENST00000474584 2268 ntTSL 214.89□□□□□ -0.031e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 MINOS1-NBL1-201ENST00000602293 820 ntTSL 314.82□□□□□ -0.041e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.051e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.071e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 MINOS1-209ENST00000498642 669 ntTSL 214.39□□□□□ -0.111e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 OAZ1-208ENST00000592727 726 ntTSL 214.37□□□□□ -0.111e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.111e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.121e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.121e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.142e-12■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 RNF123-210ENST00000487805 5882 ntTSL 214.17□□□□□ -0.141e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 ARAP1-216ENST00000542596 699 ntTSL 514.13□□□□□ -0.151e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 RPUSD1-204ENST00000563560 587 ntTSL 213.99□□□□□ -0.171e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.181e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.191e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.21e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 DCAF11-231ENST00000560614 547 ntTSL 413.73□□□□□ -0.211e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.251e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 DCAF11-220ENST00000559354 547 ntTSL 413.49□□□□□ -0.251e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 DCAF11-213ENST00000558638 581 ntTSL 413.49□□□□□ -0.251e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 ARAP1-220ENST00000544958 473 ntTSL 313.47□□□□□ -0.251e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.261e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 DCAF11-201ENST00000326009 2570 ntTSL 1 (best)13.39□□□□□ -0.271e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 MINOS1-203ENST00000467029 583 ntTSL 213.38□□□□□ -0.271e-6■■■■□ 22.4
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PRPF4O43172 DCAF11-229ENST00000560457 578 ntTSL 313.33□□□□□ -0.281e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.281e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 MINOS1-205ENST00000481464 657 ntTSL 313.26□□□□□ -0.291e-6■■■■□ 22.4
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PRPF4O43172 DCAF11-205ENST00000557802 4202 ntTSL 1 (best)12.99□□□□□ -0.331e-6■■■■□ 22.4
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PRPF4O43172 SUPT5H-220ENST00000601978 538 ntTSL 212.71□□□□□ -0.371e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 DCAF11-203ENST00000396941 2402 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.41e-6■■■■□ 22.4
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PRPF4O43172 RNF123-209ENST00000486102 4564 ntTSL 1 (best)12.44□□□□□ -0.421e-6■■■■□ 22.4
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PRPF4O43172 DCAF11-236ENST00000561041 570 ntTSL 311□□□□□ -0.651e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 RNF123-201ENST00000327697 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.651e-6■■■■□ 22.4
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PRPF4O43172 DCAF11-230ENST00000560459 587 ntTSL 410.32□□□□□ -0.761e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 RPGR-201ENST00000318842 3108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.81e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 DCAF11-209ENST00000557952 444 ntTSL 59.71□□□□□ -0.861e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 NDUFB1-206ENST00000605997 336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.861e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 KDM4B-209ENST00000592159 411 ntTSL 39.63□□□□□ -0.871e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 RPGR-202ENST00000339363 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.871e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 CEP72-202ENST00000499639 461 ntTSL 39.43□□□□□ -0.91e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 OMA1-201ENST00000371226 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.911e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 DCAF11-208ENST00000557888 552 ntTSL 49.33□□□□□ -0.921e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 DCAF11-219ENST00000559288 575 ntTSL 49.33□□□□□ -0.921e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 SNRPA-202ENST00000596860 336 ntTSL 28.64□□□□□ -1.031e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 OMA1-208ENST00000467063 458 ntTSL 37.92□□□□□ -1.141e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 ATP9B-221ENST00000590271 1923 ntTSL 27.64□□□□□ -1.191e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 DCAF11-211ENST00000558408 592 ntTSL 26.29□□□□□ -1.41e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 OMA1-206ENST00000456980 1036 ntTSL 55.96□□□□□ -1.461e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 OMA1-205ENST00000453710 744 ntTSL 55.68□□□□□ -1.51e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 OMA1-204ENST00000426139 836 ntTSL 55.58□□□□□ -1.521e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 ANKRD17-206ENST00000514252 3259 ntTSL 25.56□□□□□ -1.521e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 MBNL3-208ENST00000436215 891 ntTSL 35.28□□□□□ -1.565e-7■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 MINOS1-206ENST00000485362 438 ntTSL 25.12□□□□□ -1.591e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 OMA1-211ENST00000482274 352 ntTSL 54.05□□□□□ -1.761e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 RPGR-209ENST00000494707 426 ntTSL 52.86□□□□□ -1.951e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 GTF2I-210ENST00000490431 252 ntTSL 32.52□□□□□ -2.011e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 WDR27-211ENST00000546525 3511 ntTSL 1 (best)12.86□□□□□ -0.357e-7■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 PUS1-210ENST00000544213 687 ntTSL 523.07■■□□□ 1.281e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 WDR27-202ENST00000441385 683 ntTSL 311.71□□□□□ -0.537e-7■■■■□ 22.4
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