Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLDN25C9JDP6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms