Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC160A6NGH7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC160A6NGH7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms