Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PGPEP1LA6NFU8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGPEP1LA6NFU8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms