Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VWA3AA6NCI4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VWA3AA6NCI4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms