Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms