Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP11Q9Y3A2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms