Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP3Q9Y2W7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms