Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC4Q9Y296 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms