Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIGD1AQ9Y241 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms