Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD1Q9UIS9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms