Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI5

SLC7A8, Large neutral amino acids transporter small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A8Q9UHI5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC7A8Q9UHI5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC7A8Q9UHI5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC7A8Q9UHI5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC7A8Q9UHI5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC7A8Q9UHI5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC7A8Q9UHI5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC7A8Q9UHI5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC7A8Q9UHI5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC7A8Q9UHI5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC7A8Q9UHI5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC7A8Q9UHI5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC7A8Q9UHI5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SLC7A8Q9UHI5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC7A8Q9UHI5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms