Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NKX1-2Q9UD57 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms