Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DUX4Q9UBX2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUX4Q9UBX2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms