Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 ACSF3-211ENST00000540697 829 ntTSL 217.9■□□□□ 0.465e-6■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 TMEM161A-211ENST00000590216 789 ntTSL 517.88■□□□□ 0.455e-6■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 TMEM161A-205ENST00000587406 1923 ntTSL 517.27■□□□□ 0.365e-6■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 TMEM161A-210ENST00000589448 1799 ntTSL 517.11■□□□□ 0.335e-6■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.335e-6■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.185e-6■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.175e-6■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 TMEM161A-207ENST00000587915 540 ntTSL 416.07■□□□□ 0.165e-6■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 ACSF3-214ENST00000543676 940 ntTSL 215.9■□□□□ 0.145e-6■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.075e-6■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 DNM2-215ENST00000590806 5651 ntTSL 214.98□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.075e-6■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 TMEM161A-203ENST00000586357 482 ntTSL 414.56□□□□□ -0.085e-6■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.155e-6■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 DNM2-221ENST00000593203 2507 ntTSL 213.3□□□□□ -0.285e-6■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 TMEM161A-215ENST00000592369 528 ntTSL 313.22□□□□□ -0.295e-6■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 ACSF3-215ENST00000544543 883 ntTSL 513.22□□□□□ -0.295e-6■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 ACSF3-216ENST00000562204 581 ntTSL 312.89□□□□□ -0.355e-6■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 TMEM161A-214ENST00000592147 347 ntTSL 512.16□□□□□ -0.465e-6■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 ACSF3-210ENST00000538340 434 ntTSL 511.4□□□□□ -0.585e-6■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 DNM2-213ENST00000589106 565 ntTSL 29.69□□□□□ -0.865e-6■■■■■ 30.4
RBM22Q9NW64 LMO7-201ENST00000321797 5647 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.911e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 LMO7-218ENST00000526202 4121 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.011e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.061e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.191e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 LMO7-205ENST00000377534 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.21e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.21e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 HMGN2-205ENST00000466194 952 ntTSL 218.16■□□□□ 0.52e-10■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 HMGN2-202ENST00000460563 1045 ntTSL 510.7□□□□□ -0.72e-10■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 HMGN2-204ENST00000464888 565 ntTSL 210.59□□□□□ -0.712e-10■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 HMGN2-208ENST00000479815 1030 ntTSL 58.82□□□□□ -12e-10■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 HMGN2-203ENST00000463817 853 ntTSL 28.82□□□□□ -12e-10■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 HMGN2-206ENST00000467700 932 ntTSL 27.51□□□□□ -1.212e-10■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.292e-10■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 HMGN2-209ENST00000493418 1496 ntTSL 26.64□□□□□ -1.352e-10■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.732e-10■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.61e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.461e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 DMTN-218ENST00000522148 616 ntTSL 523.26■■□□□ 1.311e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 MBD3-208ENST00000590830 1035 ntTSL 1 (best)22.5■■□□□ 1.191e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 MBD3-205ENST00000589064 1475 ntTSL 220.82■□□□□ 0.921e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 DMTN-211ENST00000518816 997 ntTSL 220.4■□□□□ 0.861e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.851e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 MBD3-209ENST00000592012 2379 ntTSL 520.06■□□□□ 0.81e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.71e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.681e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 MAMDC4-203ENST00000479475 2603 ntTSL 1 (best)19.23■□□□□ 0.671e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.641e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 ABHD11-214ENST00000497897 1562 ntTSL 218.59■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 SBF1-203ENST00000399627 811 ntTSL 518.39■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 ABHD11-202ENST00000357419 1463 ntTSL 218.14■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 ABHD11-204ENST00000412965 852 ntTSL 317.88■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 DMTN-222ENST00000523623 581 ntTSL 317.74■□□□□ 0.431e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 DMTN-208ENST00000517418 977 ntTSL 217.73■□□□□ 0.431e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 DMTN-213ENST00000519850 587 ntTSL 417.25■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 ABHD11-212ENST00000480445 746 ntTSL 1 (best)17.23■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 DMTN-212ENST00000519333 579 ntTSL 417.07■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 DMTN-219ENST00000522340 593 ntTSL 217.05■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 DMTN-216ENST00000520174 1057 ntTSL 516.85■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 DMTN-210ENST00000517804 813 ntTSL 516.48■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 MBD3-206ENST00000589901 740 ntTSL 216.19■□□□□ 0.181e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 DMTN-221ENST00000523300 601 ntTSL 416.08■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.121e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 HDAC4-213ENST00000496347 995 ntTSL 315.73■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 RPS18-236ENST00000490191 996 ntTSL 215.57■□□□□ 0.081e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.081e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 HTT-207ENST00000509751 723 ntTSL 315.28■□□□□ 0.041e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 ABHD11-213ENST00000486114 568 ntTSL 314.61□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 ABHD11-211ENST00000474130 623 ntTSL 314.61□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 DMTN-217ENST00000520856 589 ntTSL 314.35□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 PMS1-201ENST00000342075 3012 ntTSL 214.17□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 RPS24-209ENST00000476545 815 ntTSL 313.01□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 PMS1-204ENST00000409823 2795 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.351e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.471e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 PRC1-206ENST00000555455 830 ntTSL 312.11□□□□□ -0.471e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 SBF1-208ENST00000477234 947 ntTSL 511.89□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 RPS18-233ENST00000474973 589 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 RPS18-235ENST00000479802 413 ntTSL 211.67□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 RPS18-234ENST00000476222 685 ntTSL 1 (best)11.67□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 RPS18-230ENST00000439602 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 ABHD11-206ENST00000437891 760 ntTSL 511.6□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 30.3
RBM22Q9NW64 RPS24-212ENST00000482069 539 ntTSL 311.16□□□□□ -0.621e-7■■■■■ 30.3
Retrieved 100 of 21,863 protein–RNA pairs in 84.4 ms