Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SAMSN1Q9NSI8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SAMSN1Q9NSI8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms